在不少清朝政治剧中，时常会出现“三法司”、“九卿会审”这样的词，这通常为针对死刑或是案情特别重大的情况。清朝有一套从中央到处所无比完全的司法管理体系，本文就侧重说一说清朝的审讯机关。
刑部、都察院、大理寺号称“三法司”，在乾隆朝以前是中央主管司法审讯的机关。乾隆朝之后，清朝皇帝常在三法司会审以外，再发“九卿会审”，“九卿”就是六部尚书、都察院左都御史、通政司使和大理寺卿。可见，三法司和九卿会审，形成了清朝中央级的审讯机关。
刑部号称“刑名总汇”，按当时的省份分设直隶、奉天、江苏、安徽、江西、福建、浙江、湖广、河南、山东、山西、陕西、四川、广东、广西、云南和贵州十七个清吏司，掌分核各省刑名之事，同时又另置督捕清吏司，掌理捕旗人流亡之事。另外，刑部还有权审理中央官吏的违法案件。
都察院除了负有监察职能外，所属刑科给事中满汉各一人，有“分稽刑名”事务，所设十五道分核各省之刑名案件。另外，都察院还负责京师五城巡城和受理京控直诉，即主管京城司法治安和审理词讼案件。
大理寺的司法活动和都察院相相似，分核内外之刑名。三法司之间的关系是：刑部主审讯，都察院管监察，大理寺掌复核。实际上，都察院和大理寺在清朝几近没有一点实权，真实的实权在刑部：“清则外省刑案，统由刑部核复。不会法者，院、寺无由过问，应会法者，亦由刑部主稿。在京讼狱，不管奏咨，俱由刑部审理，而部权特重。”
需要指出的是，刑部尽管权利特重，但其一切“定拟”只有奏准皇帝后，才能产生法律效率，也就是说，刑部只是皇帝行使独裁权利的一个工具。
另外，因为京城是清代的都城，满洲八旗按方位屯驻内城，因此有一套特别的司法管辖系统。
一是五城御史及其领导下的五城兵马司和步军统领，管理治安事务和一般民事纠纷，受理徒刑下列案件。京师所在地的普通满人诉讼，只能由步军统领衙门审理（杖刑下列可自行完结），一般司法机关无权审理，但步军统领衙门也有权审理汉人案件。
二是刑部，管理旗、民徒刑以上案件。按清制，京师案件不交由北京城处所当局顺天府管辖，而由刑部直接受理，但刑部审定的徒、流刑均交顺天府执行。刑部管辖和审定的京师刑事案件，在清朝特称为“现审案件”。“京师现审，徒犯发顺天府充徒，流犯由刑部定地札行顺天府起送。”
再有，内务府所管辖的满人诉讼，由内务府慎刑司审理，徒罪以上移送刑部；满族贵族宗室的诉讼，归宗人府审理；外省满人诉讼，由满洲将军和都统审理；盛京地区的满人诉讼，由盛京将军及盛京各部、府尹会同审理；漕运、河道、盐务、关税、仓场衙门的民刑诉讼案件，均移送或会同处所州县审理。
处所司法机关大体分为五个等级：第一审为厅、州、县，主座为同知、知州、知县，掌管所辖境内一切刑名事务，正如《清史稿》所说：“户、婚、田土及笞、杖轻罪，由州县完结，例称自理。”因而可知，厅、州、县可称为清朝整个司法审讯的基础。
第二审为府、直隶厅、直隶州，主座知府及同知、知州均有“决讼检奸”的职责，直接受理和复核所辖区的户婚、房产、田产、命盗等案件。
第三审为道，道分分守道与分巡道，分巡道专掌刑名，分守道专掌钱谷，二者后来的区分慢慢隐约。严格来讲，道不是一个正式的审讯机构，而是一个过渡性的单位。这是因为直隶厅、州与府平级，它自身的案件有时不好由府复审，所以转送道台。
第四审为按察司，俗称臬台，是每一个省的“刑名总汇”，专司刑名。但遇大狱时，按察司须会同布政司审理。按察司的主座按察使，是一省政权中以司法审讯为主要事务的官员。
第五审是总督、巡抚，督抚是清朝的省级主座，同驻一城者总督主事，不同城者，巡抚主事，两者并不是上下级关系。按察使尽管综理全省刑名，但终非最高主座，其实不能行使省的权利，所以必需督抚作为处所最高审讯。督抚为同一等级，巡抚所结之案一般无须再报总督。
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