EM菌被日本比嘉照夫教授发明之后,广泛应用于畜牧及水产养殖行业，EM菌就是光合菌、芽孢杆菌、硝化菌、放线菌、乳酸菌等80多种有益菌按照各自的特性组合在一起，到达最佳作用。
目前市面上的EM菌五花八门，其区别在于：
一、EM菌原种，未经过扩繁的一代水产EM菌种就是原菌，其特点是含菌量高，菌活性强，使用后能迅速发挥作用。
二、扩繁菌，顾名思义就是经过繁育以后产生的菌，可能是二代、三代扩繁，也可能多次扩繁，扩繁菌活性低，含菌量少，价格极低，不懂的消费者会贪图便宜而导致使用后基本无效果。
【适用范围】适用于各种鱼、虾、蟹、海参、泥鳅等水产养殖领域。
【养殖各个环节】海水养殖、淡水养殖、养虾育苗环节、水质调节净水肥水。
【适用于各种养殖环境】例如网箱、水库、湖泊、海水、淡水、池塘、大棚、硬池养殖。
【EM菌主要的功能】
EM益生菌能稳定和改善水质，水体颜色清爽，不臭不腐，无硫化氢、氨气等异味，能见度在25－50cm时间长且较稳定，换水时间可延长2倍以上。鱼虾粪、池底杂质和下脚料不会变成淤泥而呈散沙状。 在养鱼虾池中施放有益微生物EM益生菌，能及时降解进入水体中的有机物，如动物尸体、残饵等，减少有机耗氧，稳定pH值，同时能均衡地给单细胞藻类进行光合作用提供营养，平衡藻相和菌相，稳定池塘水色。
1、池塘处理
池塘注水前1周，用50～100倍EM益生菌稀释液代替石灰等均匀喷洒，消毒和净化池塘。
2、水质净化
EM益生菌培育后直接兑水泼洒鱼塘，多种益生菌共同作用，有效降解亚硝酸盐、氨氮，同时益生菌通过分解鱼塘底沉积的饵料和鱼粪，降解有机物含量，阻断亚硝酸盐、氨氮的再生，水体溶氧量增加，透明度维持在15-20cm，延长换水时间。
3、制作发酵料
EM益生菌腐熟肥料过程中可以去毒、杀菌，腐熟动物粪便、下脚料、秸秆等制作肥料肥水效果极佳，为鱼苗提供开口料，特别适合是鲢鱼、鳙鱼养殖。
EM益生菌拌入成品饵料可以提高饵料吸收率，降低料肉比。
4、鱼饲料的处理
由于鱼饲料为颗粒状，可用200倍的EM益生菌液喷洒饲料喷湿为度，马上投喂鱼塘用富氯消毒多久可放鱼，以免散开。
5、发酵肥水
要投入水体的有机肥（青草液肥）和粪便（鸡粪、猪粪、牛羊粪等均可）应先用EM益生菌处理，发酵后方可投入水面。
6、鱼病防治
EM益生菌富含多种益生菌，可以杀灭鱼塘中杂菌，对鱼类细菌性皮肤疾病有很好的防治作用，患病严重的可用高浓度菌液浸泡数小时。 鱼塘有机物过多，水发黑、水浑浊造成缺氧浮头，直接泼洒EM益生菌即可缓解。
【EM益生菌在水产养殖中的作用】
EM菌种发酵液渗入水体后 ，能抑制病原微生物和有害物质，调整养殖生态环境，提高水中溶氧量，促进养殖生态系中的正常菌群和有益藻类活化生长，保持养殖水体的生态平衡；拌入饵料投喂，直接增强鱼类的吸收功能和防病抗逆能力，促进健壮生长。EM菌种发酵液中的光合菌还能利用水中的硫化氢、有机酸、氨及氨基酸兼有反硝化作用消除水中的亚硝酸铵，从而净化养殖池中的排泄物和残饵，改善水质，减少鱼病。
一、减少病原微生物和不良藻类；明显增强养殖对象的免疫力和抗病性，降低发病率，提高成活率。
二、增加有益微生物数量。
三、稳定和改善水质，水体颜色清爽鱼塘用富氯消毒多久可放鱼，不臭不腐，无硫化氢、氨气等异味，能见度在25～50cm的时间长且较稳定，换水时间可延长2倍以上。
四、鱼虾粪、池底杂质和下脚料不会变成淤泥而呈散沙状。
五、促进生长，增重率明显提高。实践证明，在同等环境下，用EM益生菌后，可提前10～15天上市，平均亩产提高20％～35％，产卵量增加25％，产卵时间延长。饵料不臭，改善了养殖环境。
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